國家稅務總局近日下發《關于加強非居民企業股權轉讓所得企業所得稅管理的通知》（國稅函[2009]698號），規定自2008年1月1日起，非居民企業轉讓中國居民企業的股權（不包括在公開的證券市場買入并賣出中國居民企業的股票）所得，應自合同、協議約定的股權轉讓之日（如果轉讓方提前取得股權轉讓收入的，應自實際取得股權轉讓收入之日）起7日內，到被轉讓股權的中國居民企業所在地主管稅務機關（負責該居民企業所得稅征管的機關）申報繳納企業所得稅。

　　上述非居民企業股權轉讓所得是指其股權轉讓價減除股權成本價后的差額，其公式為：非居民企業股權轉讓所得＝股權轉讓價－股權成本價。其中，股權轉讓價是指股權轉讓人就轉讓的股權所收取的包括現金、非貨幣性資產或者權益等形式的金額。股權成本價是指股權轉讓人投資入股時向中國居民企業實際交付的出資金額，或購買該項股權時向該股權的原轉讓人實際支付的股權轉讓金額。

　　國稅函[2009]698號文件第三條第二款規定，被投資企業如有未分配利潤和稅后提存的各項基金等，股權轉讓人隨股權一并轉讓該股東留存收益權的金額，不得從股權轉讓價中扣除。這與《企業所得稅法》實施之前，非居民企業股權轉讓適用《外商投資企業和外國企業所得稅法》及國家稅務總局《印發〈關于外商投資企業合并、分立、股權重組、資產轉讓等重組業務所得稅處理的暫行規定〉的通知》（財稅[1997]71號）的規定有所不同。財稅[1997]71號文件規定，外商投資企業和外國企業，轉讓其擁有的企業的股權或股份所取得的收益時其股權轉讓價包含被持股企業的未分配利潤或稅后提存的各項基金等股東留存收益的，且股權轉讓人隨轉讓股權一并轉讓該股東留存收益權的金額（以不超過被持股企業賬面的分屬為股權轉讓人的實有金額為限），屬于該股權轉讓人的投資收益額，不計為股權轉讓價。這兩個規定存在差異的主要原因是，當時外商投資企業所得稅相關法規規定，外國投資者從外商投資企業取得的利潤，免征所得稅。而新《企業所得稅法》規定，非居民企業在中國境內設立機構、場所的，應當就其所設機構、場所取得的來源于中國境內的所得，以及發生在中國境外但與其所設機構、場所有實際聯系的所得，繳納企業所得稅。非居民企業在中國境內未設立機構、場所的，或者雖設立機構、場所但取得的所得與其所設機構、場所沒有實際聯系的，應當就其來源于中國境內的所得繳納企業所得稅。因此，非居民企業在進行股權轉讓時，如果被投資企業有未分配的利潤，其轉讓方與受讓方會因對稅后利潤處理方式不同而產生較大的納稅差異。