《國家稅務總局關于發布〈企業政策性搬遷所得稅管理辦法〉的公告》（國家稅務總局公告2012年第40號，以下簡稱第40號公告）自2012年9月下發執行以后，各地在執行該文過程中反映了一些新情況、新問題。根據各地反映，國家稅務總局下發了《國家稅務總局關于企業政策性搬遷企業所得稅有關問題的公告》，現將該公告涉及的內容解讀如下：
一、關于新舊政策銜接過渡問題
40號公告發布后，一些地方稅務機關和企業反映，由于40號公告中規定，對企業用搬遷補償收入購置新資產，不得從搬遷補償收入中扣除，對政府主導的政策性搬遷，原本搬遷補償就很拮據，如果購置資產不允許扣除，這將導致企業資金緊張，影響企業搬遷進度。因此，希望對40號公告前已經確定的政策性搬遷項目，仍然允許扣除購置資產后，再計算搬遷收益。
根據各地反映的情況，新公告就40號公告前已經確定的政策性搬遷項目做了政策調整，規定企業政策性搬遷項目凡在國家稅務總局2012年第40號公告生效前已經簽訂搬遷協議的，企業重建或恢復生產過程中按規定購置的各類資產，可以作為搬遷支出，從搬遷收入中扣除。但購置的各類資產，應剔除該搬遷補償收入后，作為該資產的計稅基數，并按規定計算折舊或費用攤銷。此后簽訂搬遷協議應按國家稅務總局2012年第40號公告有關規定執行。
二、關于資產置換稅務處理問題
根據國家稅務總局2012年第40號公告規定，企業政策性搬遷凡涉及土地置換的，其換入土地計稅成本可按被征用土在的凈值，加上換入土地應支付的稅費（涉及補價，還應加上補價款）計算確定。對于其他資產置換如何進行稅務處理，該公告未作規定。鑒于土地置換與其他資產置換性質相同，可采取同一原則進行相關的稅務處理，因此，新公告規定：企業政策性搬遷被征用的資產，采取資產置換的，其換入資產的計稅成本按被征用資產的凈值，加上換入資產所支付的稅費（涉及補價，還應加上補價款）計算確定。
三、關于執行時間問題
本公告是對國家稅務總局2012年第40號公告執行前的政策性搬遷項目作出特殊處理，因此，其執行時間應與國家稅務總局2012年第40號公告執行時間保持一致。